日本可能採取分散方式進行遣返，保釣船長等人員將乘坐原船回國。
日本內閣有關部門大臣周五（8月17日）上午針對處理保釣港人被捕的事件召開專門會議，正式確認了遣返決定並計劃政府有關各部具體討論今後防止措施。首相野田佳彥、外相玄葉光一郎、國土交通大臣羽田雄一郎、國家公安委員長松原仁等出席了會議。
內閣會議前，沖繩縣警宣佈，周五早上登陸釣魚島（日本稱尖閣諸島）的5名保釣人士移交入國管理局的手續也已開始，周四晚沖繩縣警先把9名未登陸釣魚島的香港保釣及隨行人士移交入國管理局等待遣返。多個消息來源稱，14人都將在周五被遣返香港。
不過官方電視台NHK報道說，14人都將搭乘被扣留的保釣船被遣返，而《產經新聞》報道說，兩名電視台記者和攝影師乘飛機、其他人乘船遣返。
自民黨反對論
沖繩縣警說明，被捕的保釣港人周三在釣魚島海域抵抗日本海上保安廳巡邏艦阻止他們接近釣魚島時，曾向巡邏艦扔磚頭和塑膠瓶，但並沒造成重大傷害，被捕時也沒拒捕等妨害公務的行動，所以除了非法入境外，並無其他罪狀，決定依法遣返。
不過最大在野黨自民黨周四發表聲明，指責「連串的政府應對措施是不能維護國家主權的愚行，現政權正不斷損壞國家利益」，主張搜查和起訴保釣港人，自民黨前政策調整會長石破茂等人造訪首相官邸、向內閣官房提交了聲明後說，拋磚就有涉嫌妨害公務的意圖，應嚴懲。
輿論趨於贊成
北京繼續有民眾自發前往日本駐華大使館門外示威，要求日本放人。
但日本傳媒、輿論的整體趨勢並沒顯著反對遣返措施，雖然巡邏艦在行動中受損的圖像也被各大傳媒公開，可是自民黨的前首相小泉純一郎在04年解釋遣返7名中國保釣人士的決定時說：「為了不影響中日關係大局，我想這是必要的政治判斷」的話也同時被回顧。
美國《時代周刊》日本版總編輯竹田圭吾說，既然遣返是依法處置，今年又是中日建交40週年，日本就更應顧慮氣氛，接下去還有很多紀念活動，大局也很重要。
自衛隊派駐論
引人注目的是右派報紙《產經新聞》解釋遣返說：「04年登陸尖閣諸島的7名中國人破壞了島上石碑等涉嫌損壞器物罪原該被起訴，結果是小泉以政治判斷決定遣返，那麼這次登陸者並沒損壞行為，雖然拋了磚，但沒嚴重損壞巡邏艦，又無人受傷，所以其它罪名也不適用」。
《產經新聞》引述檢查機關的話報道說：「對初次非法入境者，最終的手段就是遣送」，而入管局的看法還有：「入國起訴，法庭還可能成為他們申訴主張的場所」。
但報道也說，沖繩縣議員等質疑政府守衛釣魚島的態勢正在升高，提出釣魚島應派遣自衛隊駐守的主張。
