台灣政府官方立場是無意在釣魚台主權問題上與中國連手對抗日本
台灣外交部在日本逮捕於釣魚台（日稱：尖閣諸島）活動的保釣人士後，稱日方的逮捕無助區域和平與安全，應盡速釋放。
這群來自中港澳的保釣人士所搭的＂啟豐二號＂漁船，在周二進入台灣海域時，台灣政府曾派海巡署船艦對其提供補給。
啟豐二號除了船首有中國的五星國旗外，在船身上則有香港特區的區旗及台灣的國旗。
台外交部在要日本放人的聲明中說：＂釣魚台列嶼是中華民國固有領土、台灣附屬島嶼，任何其它各方採取的片面主張與行動均無法改變此一事實＂。
此一聲明也再一次提到馬英九的＂東海和平倡議＂，並說此倡議主要要求是籲請各方自我克制，避免對立情勢升高。
民族主義
除了這次對啟豐二號提供補給外，台灣政府上個月也曾派出海巡署五艘艦艇，護航一艘持五星旗的台灣保釣船，阻止日本海上保安廳登船。
雖然台灣政府官方立場是無意在釣魚台主權問題上與中國連手對抗日本，但在稱此一主權爭議涉＂民族大義＂的馬英九主政下，台灣政府支持這些中國民族主義下的保釣行動，引起在野黨質疑其說一套做一套。
台灣政黨間的共識是對釣魚台的主權主張，然而民進黨質疑馬英九政府相關的反應，造成國際上有台灣與中國連手對抗日本的＂錯誤印象＂。
民進黨主席蘇貞昌說，該黨希望釣魚台主權用文明與和平方式解決，而不是製造衝突。
蘇貞昌說，這次啟豐二號保釣人士喊釣魚台是中國的，喊台灣是中國一部份，這＂與台灣全體國民意志背離＂，這種方式也易引起衝突。
