日本可能采取分散方式进行遣返，保钓船长等人员将乘坐原船回国。
日本内阁有关部门大臣周五（8月17日）上午针对处理保钓港人被捕的事件召开专门会议，正式确认了遣返决定并计划政府有关各部具体讨论今后防止措施。首相野田佳彦、外相玄叶光一郎、国土交通大臣羽田雄一郎、国家公安委员长松原仁等出席了会议。
内阁会议前，冲绳县警宣布，周五早上登陆钓鱼岛（日本称尖阁诸岛）的5名保钓人士移交入国管理局的手续也已开始，周四晚冲绳县警先把9名未登陆钓鱼岛的香港保钓及随行人士移交入国管理局等待遣返。多个消息来源称，14人都将在周五被遣返香港。
不过官方电视台NHK报道说，14人都将搭乘被扣留的保钓船被遣返，而《产经新闻》报道说，两名电视台记者和摄影师乘飞机、其他人乘船遣返。
自民党反对论
冲绳县警说明，被捕的保钓港人周三在钓鱼岛海域抵抗日本海上保安厅巡逻舰阻止他们接近钓鱼岛时，曾向巡逻舰扔砖头和塑胶瓶，但并没造成重大伤害，被捕时也没拒捕等妨害公务的行动，所以除了非法入境外，并无其他罪状，决定依法遣返。
不过最大在野党自民党周四发表声明，指责连串的政府应对措施是不能维护国家主权的愚行，现政权正不断损坏国家利益，主张搜查和起诉保钓港人，自民党前政策调整会长石破茂等人造访首相官邸、向内阁官房提交了声明后说，抛砖就有涉嫌妨害公务的意图，应严惩。
舆论趋于赞成
北京继续有民众自发前往日本驻华大使馆门外示威，要求日本放人。
但日本传媒、舆论的整体趋势并没显著反对遣返措施，虽然巡逻舰在行动中受损的图像也被各大传媒公开，可是自民党的前首相小泉纯一郎在04年解释遣返7名中国保钓人士的决定时说：为了不影响中日关系大局，我想这是必要的政治判断的话也同时被回顾。
美国《时代周刊》日本版总编辑竹田圭吾说，既然遣返是依法处置，今年又是中日建交40周年，日本就更应顾虑气氛，接下去还有很多纪念活动，大局也很重要。
自卫队派驻论
引人注目的是右派报纸《产经新闻》解释遣返说：04年登陆尖阁诸岛的7名中国人破坏了岛上石碑等涉嫌损坏器物罪原该被起诉，结果是小泉以政治判断决定遣返，那么这次登陆者并没损坏行为，虽然抛了砖，但没严重损坏巡逻舰，又无人受伤，所以其它罪名也不适用。
《产经新闻》引述检查机关的话报道说：对初次非法入境者，最终的手段就是遣送，而入管局的看法还有：入国起诉，法庭还可能成为他们申诉主张的场所。
但报道也说，冲绳县议员等质疑政府守卫钓鱼岛的态势正在升高，提出钓鱼岛应派遣自卫队驻守的主张。
