台湾政府官方立场是无意在钓鱼台主权问题上与中国连手对抗日本
台湾外交部在日本逮捕于钓鱼台（日称：尖阁诸岛）活动的保钓人士后，称日方的逮捕无助区域和平与安全，应尽速释放。
这群来自中港澳的保钓人士所搭的＂启丰二号＂渔船，在周二进入台湾海域时，台湾政府曾派海巡署船舰对其提供补给。
启丰二号除了船首有中国的五星国旗外，在船身上则有香港特区的区旗及台湾的国旗。
台外交部在要日本放人的声明中说：＂钓鱼台列屿是中华民国固有领土、台湾附属岛屿，任何其它各方采取的片面主张与行动均无法改变此一事实＂。
此一声明也再一次提到马英九的＂东海和平倡议＂，并说此倡议主要要求是吁请各方自我克制，避免对立情势升高。
民族主义
除了这次对启丰二号提供补给外，台湾政府上个月也曾派出海巡署五艘舰艇，护航一艘持五星旗的台湾保钓船，阻止日本海上保安厅登船。
虽然台湾政府官方立场是无意在钓鱼台主权问题上与中国连手对抗日本，但在称此一主权争议涉＂民族大义＂的马英九主政下，台湾政府支持这些中国民族主义下的保钓行动，引起在野党质疑其说一套做一套。
台湾政党间的共识是对钓鱼台的主权主张，然而民进党质疑马英九政府相关的反应，造成国际上有台湾与中国连手对抗日本的＂错误印象＂。
民进党主席苏贞昌说，该党希望钓鱼台主权用文明与和平方式解决，而不是制造冲突。
苏贞昌说，这次启丰二号保钓人士喊钓鱼台是中国的，喊台湾是中国一部份，这＂与台湾全体国民意志背离＂，这种方式也易引起冲突。
