台灣政府在馬英九於2008年上台以來對釣魚台經常發表強硬說法
台灣海巡署否認日本媒體報導其船艦在尖閣諸島（釣魚台）海域遭日本驅離，並稱艦艇並非遭到日方飛機警告而離去。
台灣外交部也就此發表一份聲明說，外交部亞東關係協會約見日本交流協會台北事務所總務部長岡田健一，就此提出嚴正關切。
台外交部說針對日方抗議台海巡署船艦進入釣魚台列嶼海域一事，該船系配合漁業署於台灣暫定執法線內執行北方海域護漁勤務，日方應理性看待。
台灣媒體引述台外交部官員說，日本交流協會已就此一事件向台方表達抗議，且台灣外交部拒絕了日本方面的抗議。
但日本交流協會駐台北辦事處文化室官員林香織對BBC中文網說，交流協會就此一事件與台灣政府保持密切聯繫，並沒有向台方提出抗議。
她說就此一日本媒體廣泛報導事件，日本當局目前仍在調查發生的具體事實。
不同說法
日本多家媒體引述海上保安廳說，台灣海巡署的＂巡護六號＂是在周二午後被保安廳飛機發現，並在被要求離開後離去。
共同社的報導說，日本海上保安廳的飛機通過無線電詢問台灣的＂巡護六號＂航行目的，並要求其退出日本領海，＂巡護六號＂答覆說將駛離，並於午後三點半左右在大正島西北偏西22公里處駛出日本領海。
報導並說，巡護六號朝著遠離大正島（台稱：赤尾嶼）的方向航行，海上保安廳巡邏船對其持續進行監視。
台灣海巡署則發表聲明說，＂巡護六號＂是在周二午後兩點十分，遭遇日本海上保安廳PL-63公務船，雙方沒有衝突，且無日本媒體報導所稱遭警告後離去。
台海巡署並說，對於日方＂不正確＂報導，其將循適當渠道表達嚴正抗議。
東京都議員
台海巡署派出＂巡護六號＂前往該爭議海域的周二當天，據報有日本東京都議會的七名議員在海域活動，其前往該海域據信與東京市長石原慎太郎買下釣魚台的提議有關。
台外交部的聲明說，對報載這七名議員在釣魚台外圍海域＂視察＂一事，已向日方表達嚴重關切，並＂重申堅決主張擁有釣魚台主權的一貫立場＂。
台灣政府在馬英九於2008年上台以來對釣魚台經常發表強硬說法，此前行政院長並宣稱為釣魚台主權不惜同日本開戰。
台政府在兩年前並派出海巡署艦隊，保護一艘民間保釣人士租用漁船，而與日方艦隊在海上對峙。
