Ond doedd y fuddugoliaeth ddim yn ddigon i sicrhau lle'r Gleision yn rownd wyth olaf Cwpan Her Amlin, cystadleuaeth yr enillodd tîm Dai Young y tymor diwethaf.
Y tîm cartref oedd wedi hawlio unig gais y gêm gyda'r canolwr Ben Cairns yn croesi yn yr hanner cyntaf a Chris Paterson yn cyfrannu naw pwynt gyda'i droed.
Roedd y gêm yn nodi diweddglo ymgyrchoedd siomedig i'r ddau dîm yng Nghwpan Heineken, gyda Chaeredin yn gorffen ar waelod grŵp 1.
Caeredin: Thompson, L. Jones, Cairns, De Luca, Webster, Paterson, M. Blair, Jacobsen, Ford, Miven, MacLeod, Lozada, Denton, MacDonald, Grant.
Eilyddion: Traynor, G. Cross, Young, MacKenzie, McInally, Laidlaw, Samson, King.
Gleision: Czekaj, Halfpenny, Laulala, Roberts, Mustoe, Parks, Slater, Yapp, Thomas, Andrews, Jones, Tito, Pretorius, M. Williams, Molitika.
Eilyddion: G. Williams, Filise, Hobbs, B. Davies, White,
Sweeney, Hewitt, James.
Dyfarnwr: John Lacey (Iwerddon)